در مرحله اصلی رزمایش ذوالفقار ۹۹ ارتش جنگنده بمب‌افکن‌های F-4 نیروی هوایی ارتش پس از انجام پرواز برد بلند از پایگاه‌های خود به سمت منطقه عمومی رزمایش و انجام عملیات سوختگیری هوایی از هواپیمای تانکر با استفاده از موشک‌های بهینه شده نقطه‌زن و ارتقا یافته هوابه‌سطح اهداف سطحی خود را در منطقه عمومی رزمایش منهدم کردند.
در ادامه این سناریو از رزمایش همچنین جنگنده بمب‌افکن‌های F-4 با موفقیت عملیات تیراندازی به اهداف متحرک در دریا را تمرین کردند.
بمباران اهداف از پیش تعیین شده در ساحل بخش دیگری از طرح‌های عملیاتی تعیین شده در این رزمایش بوده که با موفقیت توسط فانتوم‌های نهاجا اجرا شد.
